W przeciwieństwie do kominka tradycyjnego, biokominek ma tą zaletę, że w wyniku jego użytkowania nie pojawia się sadza, popiół, ani inny osad wymagający mocnego czyszczenia.

Zwłaszcza, gdy zasila się go paliwem wysokiej jakości, praktycznie nie będzie wymagał od nas uporczywego szorowania lub mycia. Oczywiście może się on zabrudzić lub zakurzyć, jak pozostałe elementy wyposażenia domu, ale wystarczy go tylko przeczyścić zwykłymi domowymi środkami czystości. Należy jednak pamiętać, że używanie środków wyjątkowo agresywnych chemicznie nie jest wskazane. Materiały, z którego zbudowane są biokominki mogą z nimi reagować i nie będą na nie odporne. Większość biokominków odznacza się wyjątkową formą, zaprojektowaną z wykorzystaniem specyficznych materiałów. Co prawda są to głównie stal, kamień , ceramika i szkło, czyli materiały bardzo odporne na większość środków, aczkolwiek ich użycie może doprowadzić do zmiany np. połysku lub odcienia materiału. Może to mieć bardzo niekorzystny wpływ na ogólny wygląd biokominka. Dla szczególnie dbających o czystość zaleca się więc stosowanie specjalistycznych środków czyszczących przeznaczonych na dany rodzaj powierzchni.